Algoritmo evolutivo híbrido para optimización geométrica molecular
DOI:
https://doi.org/10.13053/cys-23-2-2541Palabras clave:
Optimización geométrica, algoritmo evolutivo, técnica de agrupamientoResumen
En este trabajo se desarrolla un algoritmo híbrido para el problema de optimización geométrica molecular el cual está clasificado como NP-completo, la propuesta se basa en combinar un algoritmo evolutivo con la técnica de optimización local K-Means para equilibrar la exploración y la explotación del espacio de búsqueda, para ello el algoritmo trabaja con la estructura secundaria de la molécula utilizando como componentes principales a los ángulos diedros (phi) y (psi) de la cadena principal ya que de ellos depende directamente la energía del sistema, estos ángulos se describen en una gráfica de Ramachandran y la búsqueda local trabaja sobre las regiones de valores permitidos para y de esta gráfica, de tal manera que la búsqueda es dirigida hacia las conformaciones de menor energía.Descargas
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