Exploración de Microarreglos de ADN Utilizando Minería de Datos y una Búsqueda Tabú

Autores/as

  • Luis Alberto Hernández Montiel Universidad del Istmo Campus Ixtepec
  • José-Antonio León-Borges
  • Luis David Huerta Hernández

DOI:

https://doi.org/10.13053/cys-22-2-2528

Palabras clave:

Microarreglos de ADN, Normalización, Filtrado de Datos, Selección, Clasificación, Búsqueda Local

Resumen

En este artículo, se presenta un método híbrido basado en técnicas de minería de datos y una búsqueda tabú aplicado en la selección y clasificación de genes de Microarreglos de ADN.  El método está dividido en dos etapas, en la primera etapa se utilizan cinco técnicas de filtrado de datos para eliminar toda la información no relevante de la base de datos, con los subconjuntos de genes obtenidos por esta etapa, se realiza una nueva selección de genes utilizando una búsqueda tabú, para el proceso de clasificación de los genes seleccionados, se han utilizado los clasificadores SVM, LDA, KNN por separado. El método se ha construido para obtener un subconjunto pequeño de genes de alto desempeño, los resultados obtenidos se comparan con otros métodos reportados en la literatura, este método se ha implementado en tres bases de datos de dominio público.

Biografía del autor/a

Luis Alberto Hernández Montiel, Universidad del Istmo Campus Ixtepec

se recibe como Licenciado en informática en abril del 2011, y el grado de maestro en sistemas computacionales en noviembre del 2013, por el Instituto Tecnológico de Apizaco. Actualmente es profesor-investigador de la Licenciatura en Informática en la universidad del Istmo campus Ixtepec, Oaxaca, México. Sus áreas de interés son: Algoritmos Bioinspirados, Aprendizaje Máquina, Realidad Aumentada, Metaheurísticas, Optimización y Bioinformática.

Descargas

Publicado

2018-06-28

Número

Vol. 22 Núm. 2 (2018): Thematic Issue on Numerical and Evolutionary Optimization (Guest editors: L. Trujillo, Y. Maldonado, O. Schuetze)

Sección

Artículos

Licencia

Transfiero exclusivamente a la revista “Computación y Sistemas”, editada por el Centro de Investigación en Computación (CIC), los Derechos de Autor del artículo antes mencionado, asimismo acepto que no serán transferidos a ninguna otra publicación, en cualquier formato, idioma, medio existente (incluyendo los electrónicos y multimedios) o por desarrollar.

Certifico que el artículo, no ha sido divulgado previamente o sometido simultáneamente a otra publicación y que no contiene materiales cuya publicación violaría los Derechos de Autor u otros derechos de propiedad de cualquier persona, empresa o institución. Certifico además que tengo autorización de la institución o empresa donde trabajo o estudio para publicar este Trabajo.

El autor, representante acepta la responsabilidad por la publicación del Trabajo en nombre de todos y cada uno de los autores.

Esta Transferencia está sujeta a las siguientes reservas:

  • Los autores conservan todos los derechos de propiedad (tales como derechos de patente) de este Trabajo, con excepción de los derechos de publicación transferidos al CIC, mediante este documento.
  • Los autores conservan el derecho de publicar el Trabajo total o parcialmente en cualquier libro del que ellos sean autores o editores y hacer uso personal de este trabajo en conferencias, cursos, páginas web personal, etc.